Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.52■■■■■ 4.4
PCDHB15Q9Y5E8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PCDHB15Q9Y5E8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
PCDHB15Q9Y5E8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PCDHB15Q9Y5E8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PCDHB15Q9Y5E8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PCDHB15Q9Y5E8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
PCDHB15Q9Y5E8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PCDHB15Q9Y5E8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PCDHB15Q9Y5E8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PCDHB15Q9Y5E8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PCDHB15Q9Y5E8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PCDHB15Q9Y5E8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PCDHB15Q9Y5E8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PCDHB15Q9Y5E8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PCDHB15Q9Y5E8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PCDHB15Q9Y5E8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PCDHB15Q9Y5E8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PCDHB15Q9Y5E8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
PCDHB15Q9Y5E8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PCDHB15Q9Y5E8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PCDHB15Q9Y5E8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PCDHB15Q9Y5E8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PCDHB15Q9Y5E8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PCDHB15Q9Y5E8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PCDHB15Q9Y5E8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PCDHB15Q9Y5E8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PCDHB15Q9Y5E8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PCDHB15Q9Y5E8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PCDHB15Q9Y5E8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PCDHB15Q9Y5E8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PCDHB15Q9Y5E8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PCDHB15Q9Y5E8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PCDHB15Q9Y5E8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PCDHB15Q9Y5E8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PCDHB15Q9Y5E8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PCDHB15Q9Y5E8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PCDHB15Q9Y5E8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PCDHB15Q9Y5E8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCDHB15Q9Y5E8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PCDHB15Q9Y5E8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PCDHB15Q9Y5E8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PCDHB15Q9Y5E8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
PCDHB15Q9Y5E8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PCDHB15Q9Y5E8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PCDHB15Q9Y5E8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PCDHB15Q9Y5E8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PCDHB15Q9Y5E8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PCDHB15Q9Y5E8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PCDHB15Q9Y5E8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PCDHB15Q9Y5E8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PCDHB15Q9Y5E8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PCDHB15Q9Y5E8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PCDHB15Q9Y5E8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PCDHB15Q9Y5E8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PCDHB15Q9Y5E8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PCDHB15Q9Y5E8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PCDHB15Q9Y5E8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PCDHB15Q9Y5E8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PCDHB15Q9Y5E8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PCDHB15Q9Y5E8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PCDHB15Q9Y5E8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PCDHB15Q9Y5E8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PCDHB15Q9Y5E8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PCDHB15Q9Y5E8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PCDHB15Q9Y5E8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PCDHB15Q9Y5E8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PCDHB15Q9Y5E8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PCDHB15Q9Y5E8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PCDHB15Q9Y5E8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PCDHB15Q9Y5E8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PCDHB15Q9Y5E8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PCDHB15Q9Y5E8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PCDHB15Q9Y5E8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PCDHB15Q9Y5E8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PCDHB15Q9Y5E8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PCDHB15Q9Y5E8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PCDHB15Q9Y5E8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PCDHB15Q9Y5E8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PCDHB15Q9Y5E8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PCDHB15Q9Y5E8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCDHB15Q9Y5E8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PCDHB15Q9Y5E8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PCDHB15Q9Y5E8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PCDHB15Q9Y5E8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCDHB15Q9Y5E8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PCDHB15Q9Y5E8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PCDHB15Q9Y5E8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCDHB15Q9Y5E8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PCDHB15Q9Y5E8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PCDHB15Q9Y5E8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCDHB15Q9Y5E8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PCDHB15Q9Y5E8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PCDHB15Q9Y5E8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PCDHB15Q9Y5E8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PCDHB15Q9Y5E8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PCDHB15Q9Y5E8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PCDHB15Q9Y5E8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PCDHB15Q9Y5E8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms