Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2LQ9UL33 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC2LQ9UL33 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC2LQ9UL33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2LQ9UL33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2LQ9UL33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2LQ9UL33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2LQ9UL33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2LQ9UL33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2LQ9UL33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2LQ9UL33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC2LQ9UL33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2LQ9UL33 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC2LQ9UL33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms