Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CNTNAP2Q9UHC6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNTNAP2Q9UHC6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNTNAP2Q9UHC6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNTNAP2Q9UHC6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNTNAP2Q9UHC6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNTNAP2Q9UHC6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNTNAP2Q9UHC6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP2Q9UHC6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP2Q9UHC6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNTNAP2Q9UHC6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CNTNAP2Q9UHC6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP2Q9UHC6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP2Q9UHC6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP2Q9UHC6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP2Q9UHC6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNTNAP2Q9UHC6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms