Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDRG3Q9UGV2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDRG3Q9UGV2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDRG3Q9UGV2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG3Q9UGV2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG3Q9UGV2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDRG3Q9UGV2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDRG3Q9UGV2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDRG3Q9UGV2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NDRG3Q9UGV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDRG3Q9UGV2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDRG3Q9UGV2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDRG3Q9UGV2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDRG3Q9UGV2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDRG3Q9UGV2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDRG3Q9UGV2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms