Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
IFT172Q9UG01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
IFT172Q9UG01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
IFT172Q9UG01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
IFT172Q9UG01 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
IFT172Q9UG01 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
IFT172Q9UG01 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IFT172Q9UG01 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
IFT172Q9UG01 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
IFT172Q9UG01 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
IFT172Q9UG01 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
IFT172Q9UG01 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
IFT172Q9UG01 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
IFT172Q9UG01 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
IFT172Q9UG01 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
IFT172Q9UG01 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
IFT172Q9UG01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
IFT172Q9UG01 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
IFT172Q9UG01 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
IFT172Q9UG01 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
IFT172Q9UG01 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT172Q9UG01 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
IFT172Q9UG01 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.92■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
IFT172Q9UG01 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
IFT172Q9UG01 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
IFT172Q9UG01 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
IFT172Q9UG01 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
IFT172Q9UG01 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
IFT172Q9UG01 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
IFT172Q9UG01 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
IFT172Q9UG01 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
IFT172Q9UG01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
IFT172Q9UG01 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
IFT172Q9UG01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
IFT172Q9UG01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
IFT172Q9UG01 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
IFT172Q9UG01 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
IFT172Q9UG01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
IFT172Q9UG01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.67■■■■□ 3.78
IFT172Q9UG01 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
IFT172Q9UG01 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
IFT172Q9UG01 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
IFT172Q9UG01 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms