Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS7AQ9UBW8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS7AQ9UBW8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS7AQ9UBW8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS7AQ9UBW8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS7AQ9UBW8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS7AQ9UBW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPS7AQ9UBW8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS7AQ9UBW8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS7AQ9UBW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS7AQ9UBW8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS7AQ9UBW8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS7AQ9UBW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS7AQ9UBW8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS7AQ9UBW8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS7AQ9UBW8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS7AQ9UBW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS7AQ9UBW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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