Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB2Q9UBS0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB2Q9UBS0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB2Q9UBS0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB2Q9UBS0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB2Q9UBS0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB2Q9UBS0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB2Q9UBS0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB2Q9UBS0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB2Q9UBS0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB2Q9UBS0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB2Q9UBS0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB2Q9UBS0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB2Q9UBS0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB2Q9UBS0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB2Q9UBS0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB2Q9UBS0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB2Q9UBS0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB2Q9UBS0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KB2Q9UBS0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KB2Q9UBS0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB2Q9UBS0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB2Q9UBS0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB2Q9UBS0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB2Q9UBS0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB2Q9UBS0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB2Q9UBS0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KB2Q9UBS0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KB2Q9UBS0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KB2Q9UBS0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KB2Q9UBS0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KB2Q9UBS0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB2Q9UBS0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB2Q9UBS0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB2Q9UBS0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB2Q9UBS0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB2Q9UBS0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB2Q9UBS0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms