Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC17A6Q9P2U8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC17A6Q9P2U8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC17A6Q9P2U8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC17A6Q9P2U8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC17A6Q9P2U8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC17A6Q9P2U8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC17A6Q9P2U8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC17A6Q9P2U8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC17A6Q9P2U8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC17A6Q9P2U8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC17A6Q9P2U8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC17A6Q9P2U8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC17A6Q9P2U8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC17A6Q9P2U8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms