Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL13Q9P2N7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL13Q9P2N7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL13Q9P2N7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL13Q9P2N7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL13Q9P2N7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL13Q9P2N7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL13Q9P2N7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL13Q9P2N7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL13Q9P2N7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL13Q9P2N7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL13Q9P2N7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL13Q9P2N7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL13Q9P2N7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL13Q9P2N7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL13Q9P2N7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL13Q9P2N7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL13Q9P2N7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL13Q9P2N7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL13Q9P2N7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL13Q9P2N7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL13Q9P2N7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms