Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRO2289Q9P1D8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRO2289Q9P1D8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRO2289Q9P1D8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms