Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GCNT4Q9P109 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GCNT4Q9P109 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GCNT4Q9P109 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GCNT4Q9P109 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GCNT4Q9P109 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GCNT4Q9P109 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCNT4Q9P109 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GCNT4Q9P109 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GCNT4Q9P109 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GCNT4Q9P109 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GCNT4Q9P109 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCNT4Q9P109 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GCNT4Q9P109 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GCNT4Q9P109 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCNT4Q9P109 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCNT4Q9P109 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GCNT4Q9P109 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GCNT4Q9P109 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCNT4Q9P109 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GCNT4Q9P109 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GCNT4Q9P109 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCNT4Q9P109 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCNT4Q9P109 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GCNT4Q9P109 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GCNT4Q9P109 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCNT4Q9P109 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCNT4Q9P109 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCNT4Q9P109 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms