Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TLR7Q9NYK1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TLR7Q9NYK1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TLR7Q9NYK1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TLR7Q9NYK1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TLR7Q9NYK1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TLR7Q9NYK1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TLR7Q9NYK1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TLR7Q9NYK1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TLR7Q9NYK1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TLR7Q9NYK1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TLR7Q9NYK1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TLR7Q9NYK1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TLR7Q9NYK1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TLR7Q9NYK1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TLR7Q9NYK1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TLR7Q9NYK1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TLR7Q9NYK1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TLR7Q9NYK1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TLR7Q9NYK1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TLR7Q9NYK1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TLR7Q9NYK1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TLR7Q9NYK1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TLR7Q9NYK1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TLR7Q9NYK1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TLR7Q9NYK1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TLR7Q9NYK1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TLR7Q9NYK1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TLR7Q9NYK1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TLR7Q9NYK1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TLR7Q9NYK1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TLR7Q9NYK1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TLR7Q9NYK1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TLR7Q9NYK1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TLR7Q9NYK1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TLR7Q9NYK1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TLR7Q9NYK1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TLR7Q9NYK1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TLR7Q9NYK1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TLR7Q9NYK1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TLR7Q9NYK1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TLR7Q9NYK1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TLR7Q9NYK1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TLR7Q9NYK1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TLR7Q9NYK1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TLR7Q9NYK1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TLR7Q9NYK1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms