Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV2

KCTD5, BTB/POZ domain-containing protein KCTD5, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD5Q9NXV2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD5Q9NXV2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD5Q9NXV2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms