Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV2

KCTD5, BTB/POZ domain-containing protein KCTD5, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD5Q9NXV2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD5Q9NXV2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD5Q9NXV2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCTD5Q9NXV2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCTD5Q9NXV2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD5Q9NXV2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCTD5Q9NXV2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCTD5Q9NXV2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD5Q9NXV2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD5Q9NXV2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms