Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARPBPQ9NWS1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PARPBPQ9NWS1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARPBPQ9NWS1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARPBPQ9NWS1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARPBPQ9NWS1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARPBPQ9NWS1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARPBPQ9NWS1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms