Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX18Q9NVP1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX18Q9NVP1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX18Q9NVP1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX18Q9NVP1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX18Q9NVP1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX18Q9NVP1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX18Q9NVP1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX18Q9NVP1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX18Q9NVP1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX18Q9NVP1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX18Q9NVP1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX18Q9NVP1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX18Q9NVP1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX18Q9NVP1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX18Q9NVP1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX18Q9NVP1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX18Q9NVP1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX18Q9NVP1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX18Q9NVP1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX18Q9NVP1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX18Q9NVP1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX18Q9NVP1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX18Q9NVP1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX18Q9NVP1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX18Q9NVP1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX18Q9NVP1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX18Q9NVP1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX18Q9NVP1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX18Q9NVP1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX18Q9NVP1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX18Q9NVP1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX18Q9NVP1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX18Q9NVP1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX18Q9NVP1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX18Q9NVP1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX18Q9NVP1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX18Q9NVP1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX18Q9NVP1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX18Q9NVP1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX18Q9NVP1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms