Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMP3Q9NV31 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMP3Q9NV31 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IMP3Q9NV31 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IMP3Q9NV31 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IMP3Q9NV31 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IMP3Q9NV31 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IMP3Q9NV31 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IMP3Q9NV31 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IMP3Q9NV31 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IMP3Q9NV31 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IMP3Q9NV31 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IMP3Q9NV31 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IMP3Q9NV31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IMP3Q9NV31 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IMP3Q9NV31 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IMP3Q9NV31 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IMP3Q9NV31 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IMP3Q9NV31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IMP3Q9NV31 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMP3Q9NV31 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMP3Q9NV31 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
IMP3Q9NV31 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IMP3Q9NV31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IMP3Q9NV31 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IMP3Q9NV31 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IMP3Q9NV31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IMP3Q9NV31 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms