Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP9

LIN7C, Protein lin-7 homolog C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7CQ9NUP9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7CQ9NUP9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN7CQ9NUP9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN7CQ9NUP9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN7CQ9NUP9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN7CQ9NUP9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7CQ9NUP9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN7CQ9NUP9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN7CQ9NUP9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN7CQ9NUP9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN7CQ9NUP9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LIN7CQ9NUP9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7CQ9NUP9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN7CQ9NUP9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN7CQ9NUP9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7CQ9NUP9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7CQ9NUP9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7CQ9NUP9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN7CQ9NUP9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms