Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NECTIN3Q9NQS3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NECTIN3Q9NQS3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NECTIN3Q9NQS3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NECTIN3Q9NQS3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN3Q9NQS3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NECTIN3Q9NQS3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NECTIN3Q9NQS3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NECTIN3Q9NQS3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN3Q9NQS3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN3Q9NQS3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN3Q9NQS3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms