Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS4Q9NQG7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS4Q9NQG7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS4Q9NQG7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS4Q9NQG7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS4Q9NQG7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS4Q9NQG7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS4Q9NQG7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS4Q9NQG7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS4Q9NQG7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS4Q9NQG7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS4Q9NQG7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS4Q9NQG7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS4Q9NQG7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS4Q9NQG7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS4Q9NQG7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS4Q9NQG7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPS4Q9NQG7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS4Q9NQG7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS4Q9NQG7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS4Q9NQG7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPS4Q9NQG7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPS4Q9NQG7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS4Q9NQG7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS4Q9NQG7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS4Q9NQG7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS4Q9NQG7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS4Q9NQG7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms