Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HPS4Q9NQG7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HPS4Q9NQG7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HPS4Q9NQG7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
HPS4Q9NQG7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HPS4Q9NQG7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HPS4Q9NQG7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HPS4Q9NQG7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HPS4Q9NQG7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HPS4Q9NQG7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HPS4Q9NQG7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HPS4Q9NQG7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HPS4Q9NQG7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HPS4Q9NQG7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HPS4Q9NQG7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HPS4Q9NQG7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HPS4Q9NQG7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HPS4Q9NQG7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HPS4Q9NQG7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HPS4Q9NQG7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HPS4Q9NQG7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HPS4Q9NQG7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
HPS4Q9NQG7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HPS4Q9NQG7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HPS4Q9NQG7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HPS4Q9NQG7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HPS4Q9NQG7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HPS4Q9NQG7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HPS4Q9NQG7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HPS4Q9NQG7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HPS4Q9NQG7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HPS4Q9NQG7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HPS4Q9NQG7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HPS4Q9NQG7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
HPS4Q9NQG7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HPS4Q9NQG7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
HPS4Q9NQG7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HPS4Q9NQG7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HPS4Q9NQG7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
HPS4Q9NQG7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HPS4Q9NQG7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HPS4Q9NQG7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HPS4Q9NQG7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HPS4Q9NQG7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HPS4Q9NQG7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HPS4Q9NQG7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HPS4Q9NQG7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HPS4Q9NQG7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HPS4Q9NQG7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HPS4Q9NQG7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HPS4Q9NQG7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HPS4Q9NQG7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HPS4Q9NQG7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HPS4Q9NQG7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31■■■□□ 2.55
HPS4Q9NQG7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HPS4Q9NQG7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPS4Q9NQG7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HPS4Q9NQG7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HPS4Q9NQG7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HPS4Q9NQG7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HPS4Q9NQG7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HPS4Q9NQG7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS4Q9NQG7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS4Q9NQG7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HPS4Q9NQG7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HPS4Q9NQG7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HPS4Q9NQG7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HPS4Q9NQG7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HPS4Q9NQG7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HPS4Q9NQG7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HPS4Q9NQG7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HPS4Q9NQG7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HPS4Q9NQG7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HPS4Q9NQG7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HPS4Q9NQG7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HPS4Q9NQG7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HPS4Q9NQG7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HPS4Q9NQG7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HPS4Q9NQG7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HPS4Q9NQG7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HPS4Q9NQG7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HPS4Q9NQG7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HPS4Q9NQG7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HPS4Q9NQG7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HPS4Q9NQG7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HPS4Q9NQG7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HPS4Q9NQG7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HPS4Q9NQG7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HPS4Q9NQG7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HPS4Q9NQG7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HPS4Q9NQG7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HPS4Q9NQG7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HPS4Q9NQG7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HPS4Q9NQG7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HPS4Q9NQG7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HPS4Q9NQG7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HPS4Q9NQG7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HPS4Q9NQG7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HPS4Q9NQG7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HPS4Q9NQG7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms