Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ66

PLCB1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB1Q9NQ66 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLCB1Q9NQ66 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLCB1Q9NQ66 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLCB1Q9NQ66 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLCB1Q9NQ66 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLCB1Q9NQ66 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLCB1Q9NQ66 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLCB1Q9NQ66 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLCB1Q9NQ66 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLCB1Q9NQ66 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLCB1Q9NQ66 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLCB1Q9NQ66 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLCB1Q9NQ66 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLCB1Q9NQ66 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLCB1Q9NQ66 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLCB1Q9NQ66 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLCB1Q9NQ66 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLCB1Q9NQ66 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLCB1Q9NQ66 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLCB1Q9NQ66 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLCB1Q9NQ66 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLCB1Q9NQ66 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLCB1Q9NQ66 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLCB1Q9NQ66 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLCB1Q9NQ66 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLCB1Q9NQ66 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLCB1Q9NQ66 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLCB1Q9NQ66 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLCB1Q9NQ66 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLCB1Q9NQ66 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PLCB1Q9NQ66 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLCB1Q9NQ66 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLCB1Q9NQ66 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLCB1Q9NQ66 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLCB1Q9NQ66 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLCB1Q9NQ66 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLCB1Q9NQ66 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLCB1Q9NQ66 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms