Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKKSQ9NPJ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKKSQ9NPJ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKKSQ9NPJ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKKSQ9NPJ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKKSQ9NPJ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKKSQ9NPJ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKKSQ9NPJ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKKSQ9NPJ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKKSQ9NPJ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKKSQ9NPJ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKKSQ9NPJ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MKKSQ9NPJ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKKSQ9NPJ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKKSQ9NPJ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKKSQ9NPJ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKKSQ9NPJ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MKKSQ9NPJ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKKSQ9NPJ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKKSQ9NPJ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKKSQ9NPJ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKKSQ9NPJ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKKSQ9NPJ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms