Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNPLA8Q9NP80 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNPLA8Q9NP80 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNPLA8Q9NP80 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNPLA8Q9NP80 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNPLA8Q9NP80 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNPLA8Q9NP80 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNPLA8Q9NP80 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNPLA8Q9NP80 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNPLA8Q9NP80 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNPLA8Q9NP80 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNPLA8Q9NP80 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNPLA8Q9NP80 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNPLA8Q9NP80 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNPLA8Q9NP80 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNPLA8Q9NP80 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNPLA8Q9NP80 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNPLA8Q9NP80 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNPLA8Q9NP80 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNPLA8Q9NP80 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNPLA8Q9NP80 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNPLA8Q9NP80 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNPLA8Q9NP80 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PNPLA8Q9NP80 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms