Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PNPLA8Q9NP80 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PNPLA8Q9NP80 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PNPLA8Q9NP80 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PNPLA8Q9NP80 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PNPLA8Q9NP80 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PNPLA8Q9NP80 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
PNPLA8Q9NP80 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PNPLA8Q9NP80 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PNPLA8Q9NP80 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PNPLA8Q9NP80 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PNPLA8Q9NP80 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PNPLA8Q9NP80 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PNPLA8Q9NP80 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PNPLA8Q9NP80 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PNPLA8Q9NP80 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PNPLA8Q9NP80 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PNPLA8Q9NP80 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PNPLA8Q9NP80 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PNPLA8Q9NP80 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PNPLA8Q9NP80 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PNPLA8Q9NP80 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PNPLA8Q9NP80 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PNPLA8Q9NP80 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PNPLA8Q9NP80 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PNPLA8Q9NP80 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PNPLA8Q9NP80 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PNPLA8Q9NP80 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PNPLA8Q9NP80 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PNPLA8Q9NP80 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PNPLA8Q9NP80 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PNPLA8Q9NP80 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PNPLA8Q9NP80 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PNPLA8Q9NP80 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PNPLA8Q9NP80 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PNPLA8Q9NP80 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PNPLA8Q9NP80 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PNPLA8Q9NP80 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PNPLA8Q9NP80 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PNPLA8Q9NP80 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PNPLA8Q9NP80 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PNPLA8Q9NP80 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PNPLA8Q9NP80 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PNPLA8Q9NP80 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PNPLA8Q9NP80 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PNPLA8Q9NP80 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PNPLA8Q9NP80 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PNPLA8Q9NP80 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PNPLA8Q9NP80 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PNPLA8Q9NP80 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PNPLA8Q9NP80 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PNPLA8Q9NP80 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PNPLA8Q9NP80 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PNPLA8Q9NP80 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PNPLA8Q9NP80 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PNPLA8Q9NP80 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PNPLA8Q9NP80 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PNPLA8Q9NP80 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PNPLA8Q9NP80 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PNPLA8Q9NP80 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PNPLA8Q9NP80 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PNPLA8Q9NP80 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PNPLA8Q9NP80 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PNPLA8Q9NP80 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PNPLA8Q9NP80 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PNPLA8Q9NP80 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PNPLA8Q9NP80 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PNPLA8Q9NP80 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PNPLA8Q9NP80 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PNPLA8Q9NP80 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PNPLA8Q9NP80 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PNPLA8Q9NP80 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PNPLA8Q9NP80 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PNPLA8Q9NP80 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PNPLA8Q9NP80 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PNPLA8Q9NP80 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PNPLA8Q9NP80 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PNPLA8Q9NP80 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PNPLA8Q9NP80 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PNPLA8Q9NP80 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PNPLA8Q9NP80 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PNPLA8Q9NP80 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PNPLA8Q9NP80 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PNPLA8Q9NP80 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PNPLA8Q9NP80 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PNPLA8Q9NP80 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PNPLA8Q9NP80 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PNPLA8Q9NP80 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PNPLA8Q9NP80 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNPLA8Q9NP80 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNPLA8Q9NP80 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PNPLA8Q9NP80 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PNPLA8Q9NP80 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PNPLA8Q9NP80 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PNPLA8Q9NP80 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PNPLA8Q9NP80 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PNPLA8Q9NP80 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PNPLA8Q9NP80 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PNPLA8Q9NP80 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PNPLA8Q9NP80 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms