Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRHQ9HD43 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRHQ9HD43 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRHQ9HD43 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRHQ9HD43 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRHQ9HD43 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRHQ9HD43 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRHQ9HD43 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRHQ9HD43 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRHQ9HD43 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRHQ9HD43 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRHQ9HD43 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRHQ9HD43 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRHQ9HD43 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRHQ9HD43 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRHQ9HD43 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRHQ9HD43 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRHQ9HD43 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRHQ9HD43 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRHQ9HD43 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRHQ9HD43 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRHQ9HD43 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRHQ9HD43 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRHQ9HD43 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRHQ9HD43 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRHQ9HD43 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRHQ9HD43 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRHQ9HD43 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRHQ9HD43 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRHQ9HD43 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRHQ9HD43 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRHQ9HD43 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRHQ9HD43 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRHQ9HD43 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRHQ9HD43 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRHQ9HD43 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRHQ9HD43 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRHQ9HD43 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRHQ9HD43 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRHQ9HD43 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRHQ9HD43 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRHQ9HD43 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRHQ9HD43 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRHQ9HD43 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRHQ9HD43 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRHQ9HD43 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRHQ9HD43 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRHQ9HD43 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRHQ9HD43 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRHQ9HD43 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
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