Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EPB41L4AQ9HCS5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EPB41L4AQ9HCS5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EPB41L4AQ9HCS5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
EPB41L4AQ9HCS5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EPB41L4AQ9HCS5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EPB41L4AQ9HCS5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EPB41L4AQ9HCS5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EPB41L4AQ9HCS5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EPB41L4AQ9HCS5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EPB41L4AQ9HCS5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EPB41L4AQ9HCS5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EPB41L4AQ9HCS5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EPB41L4AQ9HCS5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EPB41L4AQ9HCS5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
EPB41L4AQ9HCS5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EPB41L4AQ9HCS5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EPB41L4AQ9HCS5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EPB41L4AQ9HCS5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EPB41L4AQ9HCS5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EPB41L4AQ9HCS5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EPB41L4AQ9HCS5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EPB41L4AQ9HCS5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EPB41L4AQ9HCS5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
EPB41L4AQ9HCS5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
EPB41L4AQ9HCS5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
EPB41L4AQ9HCS5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EPB41L4AQ9HCS5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
EPB41L4AQ9HCS5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EPB41L4AQ9HCS5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EPB41L4AQ9HCS5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EPB41L4AQ9HCS5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EPB41L4AQ9HCS5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EPB41L4AQ9HCS5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EPB41L4AQ9HCS5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EPB41L4AQ9HCS5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
EPB41L4AQ9HCS5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
EPB41L4AQ9HCS5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EPB41L4AQ9HCS5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EPB41L4AQ9HCS5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
EPB41L4AQ9HCS5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EPB41L4AQ9HCS5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EPB41L4AQ9HCS5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EPB41L4AQ9HCS5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EPB41L4AQ9HCS5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
EPB41L4AQ9HCS5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
EPB41L4AQ9HCS5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms