Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNDIG1Q9H7V2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNDIG1Q9H7V2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNDIG1Q9H7V2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNDIG1Q9H7V2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNDIG1Q9H7V2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNDIG1Q9H7V2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNDIG1Q9H7V2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNDIG1Q9H7V2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNDIG1Q9H7V2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNDIG1Q9H7V2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNDIG1Q9H7V2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNDIG1Q9H7V2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNDIG1Q9H7V2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNDIG1Q9H7V2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNDIG1Q9H7V2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms