Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPR88Q9GZN0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPR88Q9GZN0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPR88Q9GZN0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPR88Q9GZN0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPR88Q9GZN0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPR88Q9GZN0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GPR88Q9GZN0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPR88Q9GZN0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPR88Q9GZN0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPR88Q9GZN0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPR88Q9GZN0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPR88Q9GZN0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPR88Q9GZN0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPR88Q9GZN0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPR88Q9GZN0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPR88Q9GZN0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPR88Q9GZN0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPR88Q9GZN0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GPR88Q9GZN0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GPR88Q9GZN0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GPR88Q9GZN0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPR88Q9GZN0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPR88Q9GZN0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPR88Q9GZN0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPR88Q9GZN0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPR88Q9GZN0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPR88Q9GZN0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GPR88Q9GZN0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPR88Q9GZN0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPR88Q9GZN0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPR88Q9GZN0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPR88Q9GZN0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPR88Q9GZN0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPR88Q9GZN0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPR88Q9GZN0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPR88Q9GZN0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPR88Q9GZN0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPR88Q9GZN0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPR88Q9GZN0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPR88Q9GZN0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPR88Q9GZN0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPR88Q9GZN0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPR88Q9GZN0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GPR88Q9GZN0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPR88Q9GZN0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms