Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM2Q9C040 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM2Q9C040 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM2Q9C040 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM2Q9C040 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM2Q9C040 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM2Q9C040 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM2Q9C040 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM2Q9C040 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM2Q9C040 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM2Q9C040 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM2Q9C040 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM2Q9C040 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM2Q9C040 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM2Q9C040 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM2Q9C040 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM2Q9C040 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM2Q9C040 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM2Q9C040 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM2Q9C040 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM2Q9C040 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM2Q9C040 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM2Q9C040 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM2Q9C040 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms