Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
UPF3BQ9BZI7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
UPF3BQ9BZI7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
UPF3BQ9BZI7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
UPF3BQ9BZI7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UPF3BQ9BZI7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UPF3BQ9BZI7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
UPF3BQ9BZI7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
UPF3BQ9BZI7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
UPF3BQ9BZI7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
UPF3BQ9BZI7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
UPF3BQ9BZI7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
UPF3BQ9BZI7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
UPF3BQ9BZI7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
UPF3BQ9BZI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
UPF3BQ9BZI7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
UPF3BQ9BZI7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
UPF3BQ9BZI7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
UPF3BQ9BZI7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
UPF3BQ9BZI7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
UPF3BQ9BZI7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
UPF3BQ9BZI7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
UPF3BQ9BZI7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
UPF3BQ9BZI7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
UPF3BQ9BZI7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UPF3BQ9BZI7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UPF3BQ9BZI7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
UPF3BQ9BZI7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
UPF3BQ9BZI7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
UPF3BQ9BZI7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
UPF3BQ9BZI7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
UPF3BQ9BZI7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
UPF3BQ9BZI7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
UPF3BQ9BZI7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
UPF3BQ9BZI7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
UPF3BQ9BZI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UPF3BQ9BZI7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UPF3BQ9BZI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms