Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC3Q9BY71 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC3Q9BY71 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC3Q9BY71 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC3Q9BY71 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC3Q9BY71 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC3Q9BY71 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC3Q9BY71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC3Q9BY71 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC3Q9BY71 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC3Q9BY71 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC3Q9BY71 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC3Q9BY71 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC3Q9BY71 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC3Q9BY71 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC3Q9BY71 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC3Q9BY71 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC3Q9BY71 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC3Q9BY71 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC3Q9BY71 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC3Q9BY71 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms