Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC94Q9BW85 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC94Q9BW85 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC94Q9BW85 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC94Q9BW85 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC94Q9BW85 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC94Q9BW85 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC94Q9BW85 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC94Q9BW85 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC94Q9BW85 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC94Q9BW85 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC94Q9BW85 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC94Q9BW85 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC94Q9BW85 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC94Q9BW85 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC94Q9BW85 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC94Q9BW85 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC94Q9BW85 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms