Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC77Q9BR77 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC77Q9BR77 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC77Q9BR77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC77Q9BR77 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC77Q9BR77 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC77Q9BR77 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC77Q9BR77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC77Q9BR77 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC77Q9BR77 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC77Q9BR77 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC77Q9BR77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC77Q9BR77 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC77Q9BR77 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC77Q9BR77 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC77Q9BR77 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC77Q9BR77 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC77Q9BR77 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC77Q9BR77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC77Q9BR77 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC77Q9BR77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC77Q9BR77 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC77Q9BR77 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC77Q9BR77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms