Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC77Q9BR77 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC77Q9BR77 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC77Q9BR77 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC77Q9BR77 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC77Q9BR77 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC77Q9BR77 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC77Q9BR77 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC77Q9BR77 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC77Q9BR77 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC77Q9BR77 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC77Q9BR77 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC77Q9BR77 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC77Q9BR77 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC77Q9BR77 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC77Q9BR77 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC77Q9BR77 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC77Q9BR77 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC77Q9BR77 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC77Q9BR77 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC77Q9BR77 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC77Q9BR77 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC77Q9BR77 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC77Q9BR77 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC77Q9BR77 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC77Q9BR77 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC77Q9BR77 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC77Q9BR77 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC77Q9BR77 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC77Q9BR77 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC77Q9BR77 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC77Q9BR77 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC77Q9BR77 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC77Q9BR77 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC77Q9BR77 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC77Q9BR77 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC77Q9BR77 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC77Q9BR77 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC77Q9BR77 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC77Q9BR77 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC77Q9BR77 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC77Q9BR77 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC77Q9BR77 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC77Q9BR77 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC77Q9BR77 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC77Q9BR77 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC77Q9BR77 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC77Q9BR77 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC77Q9BR77 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC77Q9BR77 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC77Q9BR77 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC77Q9BR77 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC77Q9BR77 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC77Q9BR77 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC77Q9BR77 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC77Q9BR77 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC77Q9BR77 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC77Q9BR77 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC77Q9BR77 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC77Q9BR77 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC77Q9BR77 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC77Q9BR77 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC77Q9BR77 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC77Q9BR77 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC77Q9BR77 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC77Q9BR77 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC77Q9BR77 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC77Q9BR77 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC77Q9BR77 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC77Q9BR77 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC77Q9BR77 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC77Q9BR77 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC77Q9BR77 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC77Q9BR77 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC77Q9BR77 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC77Q9BR77 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC77Q9BR77 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC77Q9BR77 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC77Q9BR77 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC77Q9BR77 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC77Q9BR77 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC77Q9BR77 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC77Q9BR77 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC77Q9BR77 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC77Q9BR77 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC77Q9BR77 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC77Q9BR77 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC77Q9BR77 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC77Q9BR77 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC77Q9BR77 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC77Q9BR77 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC77Q9BR77 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC77Q9BR77 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC77Q9BR77 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC77Q9BR77 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC77Q9BR77 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC77Q9BR77 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC77Q9BR77 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC77Q9BR77 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC77Q9BR77 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms