Protein–RNA interactions for Protein: Q99677

LPAR4, Lysophosphatidic acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR4Q99677 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPAR4Q99677 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPAR4Q99677 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPAR4Q99677 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPAR4Q99677 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPAR4Q99677 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LPAR4Q99677 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPAR4Q99677 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPAR4Q99677 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPAR4Q99677 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPAR4Q99677 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPAR4Q99677 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPAR4Q99677 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPAR4Q99677 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPAR4Q99677 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LPAR4Q99677 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LPAR4Q99677 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPAR4Q99677 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPAR4Q99677 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPAR4Q99677 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LPAR4Q99677 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms