Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP7

GAL3ST4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST4Q96RP7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GAL3ST4Q96RP7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAL3ST4Q96RP7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAL3ST4Q96RP7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAL3ST4Q96RP7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GAL3ST4Q96RP7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GAL3ST4Q96RP7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAL3ST4Q96RP7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAL3ST4Q96RP7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GAL3ST4Q96RP7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GAL3ST4Q96RP7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GAL3ST4Q96RP7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GAL3ST4Q96RP7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GAL3ST4Q96RP7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GAL3ST4Q96RP7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GAL3ST4Q96RP7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GAL3ST4Q96RP7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GAL3ST4Q96RP7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GAL3ST4Q96RP7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GAL3ST4Q96RP7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GAL3ST4Q96RP7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAL3ST4Q96RP7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAL3ST4Q96RP7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GAL3ST4Q96RP7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAL3ST4Q96RP7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms