Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRNT1Q96Q11 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRNT1Q96Q11 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRNT1Q96Q11 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRNT1Q96Q11 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRNT1Q96Q11 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRNT1Q96Q11 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRNT1Q96Q11 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRNT1Q96Q11 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRNT1Q96Q11 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRNT1Q96Q11 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRNT1Q96Q11 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNT1Q96Q11 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNT1Q96Q11 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNT1Q96Q11 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNT1Q96Q11 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNT1Q96Q11 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNT1Q96Q11 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNT1Q96Q11 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNT1Q96Q11 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNT1Q96Q11 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRNT1Q96Q11 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNT1Q96Q11 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNT1Q96Q11 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNT1Q96Q11 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRNT1Q96Q11 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNT1Q96Q11 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNT1Q96Q11 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRNT1Q96Q11 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNT1Q96Q11 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNT1Q96Q11 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNT1Q96Q11 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
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