Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRNT1Q96Q11 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRNT1Q96Q11 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
TRNT1Q96Q11 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRNT1Q96Q11 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRNT1Q96Q11 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRNT1Q96Q11 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRNT1Q96Q11 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRNT1Q96Q11 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRNT1Q96Q11 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRNT1Q96Q11 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRNT1Q96Q11 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRNT1Q96Q11 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRNT1Q96Q11 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRNT1Q96Q11 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRNT1Q96Q11 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRNT1Q96Q11 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRNT1Q96Q11 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRNT1Q96Q11 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRNT1Q96Q11 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRNT1Q96Q11 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRNT1Q96Q11 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRNT1Q96Q11 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRNT1Q96Q11 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRNT1Q96Q11 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRNT1Q96Q11 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRNT1Q96Q11 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRNT1Q96Q11 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRNT1Q96Q11 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRNT1Q96Q11 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRNT1Q96Q11 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRNT1Q96Q11 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRNT1Q96Q11 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRNT1Q96Q11 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRNT1Q96Q11 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRNT1Q96Q11 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRNT1Q96Q11 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRNT1Q96Q11 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRNT1Q96Q11 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRNT1Q96Q11 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRNT1Q96Q11 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRNT1Q96Q11 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRNT1Q96Q11 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRNT1Q96Q11 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRNT1Q96Q11 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRNT1Q96Q11 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRNT1Q96Q11 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRNT1Q96Q11 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRNT1Q96Q11 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRNT1Q96Q11 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRNT1Q96Q11 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRNT1Q96Q11 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRNT1Q96Q11 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRNT1Q96Q11 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRNT1Q96Q11 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRNT1Q96Q11 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRNT1Q96Q11 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRNT1Q96Q11 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRNT1Q96Q11 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRNT1Q96Q11 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRNT1Q96Q11 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRNT1Q96Q11 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRNT1Q96Q11 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRNT1Q96Q11 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRNT1Q96Q11 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRNT1Q96Q11 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRNT1Q96Q11 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRNT1Q96Q11 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRNT1Q96Q11 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRNT1Q96Q11 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRNT1Q96Q11 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRNT1Q96Q11 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRNT1Q96Q11 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRNT1Q96Q11 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRNT1Q96Q11 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRNT1Q96Q11 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRNT1Q96Q11 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRNT1Q96Q11 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRNT1Q96Q11 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRNT1Q96Q11 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRNT1Q96Q11 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRNT1Q96Q11 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRNT1Q96Q11 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRNT1Q96Q11 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRNT1Q96Q11 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRNT1Q96Q11 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRNT1Q96Q11 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRNT1Q96Q11 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRNT1Q96Q11 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRNT1Q96Q11 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRNT1Q96Q11 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRNT1Q96Q11 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRNT1Q96Q11 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRNT1Q96Q11 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRNT1Q96Q11 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRNT1Q96Q11 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRNT1Q96Q11 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRNT1Q96Q11 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRNT1Q96Q11 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRNT1Q96Q11 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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