Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSNARE1Q96NA8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSNARE1Q96NA8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSNARE1Q96NA8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSNARE1Q96NA8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSNARE1Q96NA8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSNARE1Q96NA8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSNARE1Q96NA8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSNARE1Q96NA8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSNARE1Q96NA8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSNARE1Q96NA8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1Q96NA8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1Q96NA8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1Q96NA8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSNARE1Q96NA8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSNARE1Q96NA8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1Q96NA8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSNARE1Q96NA8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSNARE1Q96NA8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms