Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF488Q96MN9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF488Q96MN9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF488Q96MN9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF488Q96MN9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF488Q96MN9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF488Q96MN9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF488Q96MN9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF488Q96MN9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF488Q96MN9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF488Q96MN9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF488Q96MN9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF488Q96MN9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF488Q96MN9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF488Q96MN9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF488Q96MN9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF488Q96MN9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms