Protein–RNA interactions for Protein: Q96L50

LRR1, Leucine-rich repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRR1Q96L50 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRR1Q96L50 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRR1Q96L50 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRR1Q96L50 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRR1Q96L50 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRR1Q96L50 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRR1Q96L50 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRR1Q96L50 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRR1Q96L50 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRR1Q96L50 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRR1Q96L50 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRR1Q96L50 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRR1Q96L50 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRR1Q96L50 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRR1Q96L50 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms