Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BORCS6Q96GS4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BORCS6Q96GS4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BORCS6Q96GS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
BORCS6Q96GS4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BORCS6Q96GS4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BORCS6Q96GS4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BORCS6Q96GS4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BORCS6Q96GS4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
BORCS6Q96GS4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BORCS6Q96GS4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BORCS6Q96GS4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BORCS6Q96GS4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BORCS6Q96GS4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BORCS6Q96GS4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BORCS6Q96GS4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BORCS6Q96GS4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BORCS6Q96GS4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BORCS6Q96GS4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BORCS6Q96GS4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BORCS6Q96GS4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BORCS6Q96GS4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
BORCS6Q96GS4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BORCS6Q96GS4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BORCS6Q96GS4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BORCS6Q96GS4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BORCS6Q96GS4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BORCS6Q96GS4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BORCS6Q96GS4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BORCS6Q96GS4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BORCS6Q96GS4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BORCS6Q96GS4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BORCS6Q96GS4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms