Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VOPP1Q96AW1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VOPP1Q96AW1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VOPP1Q96AW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VOPP1Q96AW1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VOPP1Q96AW1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VOPP1Q96AW1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VOPP1Q96AW1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VOPP1Q96AW1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VOPP1Q96AW1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VOPP1Q96AW1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VOPP1Q96AW1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VOPP1Q96AW1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VOPP1Q96AW1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VOPP1Q96AW1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VOPP1Q96AW1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VOPP1Q96AW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VOPP1Q96AW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VOPP1Q96AW1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VOPP1Q96AW1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VOPP1Q96AW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VOPP1Q96AW1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VOPP1Q96AW1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VOPP1Q96AW1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VOPP1Q96AW1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VOPP1Q96AW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VOPP1Q96AW1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms