Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RABGGTAQ92696 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RABGGTAQ92696 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RABGGTAQ92696 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RABGGTAQ92696 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RABGGTAQ92696 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RABGGTAQ92696 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RABGGTAQ92696 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RABGGTAQ92696 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RABGGTAQ92696 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RABGGTAQ92696 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RABGGTAQ92696 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABGGTAQ92696 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABGGTAQ92696 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABGGTAQ92696 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABGGTAQ92696 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABGGTAQ92696 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RABGGTAQ92696 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RABGGTAQ92696 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RABGGTAQ92696 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RABGGTAQ92696 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RABGGTAQ92696 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RABGGTAQ92696 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABGGTAQ92696 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGGTAQ92696 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGGTAQ92696 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGGTAQ92696 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABGGTAQ92696 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABGGTAQ92696 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RABGGTAQ92696 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABGGTAQ92696 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RABGGTAQ92696 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
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