Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RABGGTAQ92696 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RABGGTAQ92696 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RABGGTAQ92696 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RABGGTAQ92696 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RABGGTAQ92696 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RABGGTAQ92696 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RABGGTAQ92696 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
RABGGTAQ92696 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RABGGTAQ92696 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RABGGTAQ92696 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RABGGTAQ92696 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RABGGTAQ92696 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RABGGTAQ92696 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RABGGTAQ92696 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RABGGTAQ92696 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RABGGTAQ92696 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RABGGTAQ92696 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RABGGTAQ92696 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RABGGTAQ92696 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RABGGTAQ92696 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RABGGTAQ92696 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RABGGTAQ92696 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RABGGTAQ92696 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RABGGTAQ92696 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RABGGTAQ92696 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RABGGTAQ92696 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RABGGTAQ92696 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RABGGTAQ92696 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RABGGTAQ92696 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RABGGTAQ92696 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RABGGTAQ92696 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RABGGTAQ92696 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RABGGTAQ92696 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RABGGTAQ92696 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RABGGTAQ92696 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RABGGTAQ92696 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RABGGTAQ92696 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RABGGTAQ92696 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RABGGTAQ92696 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RABGGTAQ92696 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RABGGTAQ92696 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RABGGTAQ92696 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RABGGTAQ92696 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RABGGTAQ92696 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RABGGTAQ92696 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RABGGTAQ92696 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RABGGTAQ92696 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RABGGTAQ92696 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RABGGTAQ92696 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RABGGTAQ92696 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33■■■□□ 2.87
RABGGTAQ92696 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RABGGTAQ92696 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RABGGTAQ92696 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RABGGTAQ92696 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RABGGTAQ92696 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RABGGTAQ92696 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RABGGTAQ92696 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RABGGTAQ92696 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RABGGTAQ92696 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RABGGTAQ92696 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RABGGTAQ92696 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RABGGTAQ92696 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
RABGGTAQ92696 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RABGGTAQ92696 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RABGGTAQ92696 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RABGGTAQ92696 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RABGGTAQ92696 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RABGGTAQ92696 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RABGGTAQ92696 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RABGGTAQ92696 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RABGGTAQ92696 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RABGGTAQ92696 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RABGGTAQ92696 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RABGGTAQ92696 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RABGGTAQ92696 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RABGGTAQ92696 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RABGGTAQ92696 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RABGGTAQ92696 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RABGGTAQ92696 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RABGGTAQ92696 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RABGGTAQ92696 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RABGGTAQ92696 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RABGGTAQ92696 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RABGGTAQ92696 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RABGGTAQ92696 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RABGGTAQ92696 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RABGGTAQ92696 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RABGGTAQ92696 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
RABGGTAQ92696 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RABGGTAQ92696 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RABGGTAQ92696 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RABGGTAQ92696 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
RABGGTAQ92696 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RABGGTAQ92696 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RABGGTAQ92696 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RABGGTAQ92696 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RABGGTAQ92696 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RABGGTAQ92696 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RABGGTAQ92696 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
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