Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
TRIM41Q8WV44 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
TRIM41Q8WV44 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
TRIM41Q8WV44 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
TRIM41Q8WV44 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
TRIM41Q8WV44 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
TRIM41Q8WV44 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC47.07■■■■■ 5.13
TRIM41Q8WV44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
TRIM41Q8WV44 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
TRIM41Q8WV44 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
TRIM41Q8WV44 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
TRIM41Q8WV44 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
TRIM41Q8WV44 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
TRIM41Q8WV44 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
TRIM41Q8WV44 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
TRIM41Q8WV44 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
TRIM41Q8WV44 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
TRIM41Q8WV44 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
TRIM41Q8WV44 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.94■■■■■ 5.1
TRIM41Q8WV44 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
TRIM41Q8WV44 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
TRIM41Q8WV44 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
TRIM41Q8WV44 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
TRIM41Q8WV44 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
TRIM41Q8WV44 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC46.89■■■■■ 5.1
TRIM41Q8WV44 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
TRIM41Q8WV44 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC46.85■■■■■ 5.09
TRIM41Q8WV44 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
TRIM41Q8WV44 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
TRIM41Q8WV44 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
TRIM41Q8WV44 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46.77■■■■■ 5.08
TRIM41Q8WV44 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
TRIM41Q8WV44 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC46.76■■■■■ 5.08
TRIM41Q8WV44 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
TRIM41Q8WV44 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
TRIM41Q8WV44 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
TRIM41Q8WV44 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
TRIM41Q8WV44 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
TRIM41Q8WV44 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC46.69■■■■■ 5.06
TRIM41Q8WV44 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
TRIM41Q8WV44 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
TRIM41Q8WV44 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
TRIM41Q8WV44 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
TRIM41Q8WV44 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC46.65■■■■■ 5.06
TRIM41Q8WV44 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
TRIM41Q8WV44 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
TRIM41Q8WV44 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
TRIM41Q8WV44 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC46.62■■■■■ 5.05
TRIM41Q8WV44 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
TRIM41Q8WV44 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC46.62■■■■■ 5.05
TRIM41Q8WV44 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
TRIM41Q8WV44 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
TRIM41Q8WV44 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
TRIM41Q8WV44 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
TRIM41Q8WV44 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
TRIM41Q8WV44 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
TRIM41Q8WV44 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC46.54■■■■■ 5.04
TRIM41Q8WV44 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.53■■■■■ 5.04
TRIM41Q8WV44 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
TRIM41Q8WV44 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC46.51■■■■■ 5.04
TRIM41Q8WV44 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
TRIM41Q8WV44 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
TRIM41Q8WV44 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
TRIM41Q8WV44 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
TRIM41Q8WV44 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
TRIM41Q8WV44 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
TRIM41Q8WV44 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
TRIM41Q8WV44 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC46.44■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC46.43■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.41■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC46.41■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.02
TRIM41Q8WV44 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
TRIM41Q8WV44 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
TRIM41Q8WV44 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
TRIM41Q8WV44 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
TRIM41Q8WV44 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
TRIM41Q8WV44 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
TRIM41Q8WV44 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
TRIM41Q8WV44 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
TRIM41Q8WV44 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
TRIM41Q8WV44 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
TRIM41Q8WV44 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
TRIM41Q8WV44 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
TRIM41Q8WV44 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms