Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GSDMBQ8TAX9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GSDMBQ8TAX9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GSDMBQ8TAX9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GSDMBQ8TAX9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GSDMBQ8TAX9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GSDMBQ8TAX9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GSDMBQ8TAX9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GSDMBQ8TAX9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSDMBQ8TAX9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSDMBQ8TAX9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMBQ8TAX9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMBQ8TAX9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSDMBQ8TAX9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSDMBQ8TAX9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSDMBQ8TAX9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSDMBQ8TAX9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSDMBQ8TAX9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GSDMBQ8TAX9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSDMBQ8TAX9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMBQ8TAX9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSDMBQ8TAX9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSDMBQ8TAX9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSDMBQ8TAX9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSDMBQ8TAX9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSDMBQ8TAX9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSDMBQ8TAX9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSDMBQ8TAX9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSDMBQ8TAX9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSDMBQ8TAX9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSDMBQ8TAX9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSDMBQ8TAX9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSDMBQ8TAX9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSDMBQ8TAX9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSDMBQ8TAX9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GSDMBQ8TAX9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GSDMBQ8TAX9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GSDMBQ8TAX9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSDMBQ8TAX9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms