Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG7

DENND6B, Protein DENND6B, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND6BQ8NEG7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND6BQ8NEG7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DENND6BQ8NEG7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND6BQ8NEG7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND6BQ8NEG7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND6BQ8NEG7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND6BQ8NEG7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DENND6BQ8NEG7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND6BQ8NEG7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND6BQ8NEG7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND6BQ8NEG7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND6BQ8NEG7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND6BQ8NEG7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND6BQ8NEG7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND6BQ8NEG7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND6BQ8NEG7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms