Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC150Q8NCX0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC150Q8NCX0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC150Q8NCX0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC150Q8NCX0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC150Q8NCX0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC150Q8NCX0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC150Q8NCX0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC150Q8NCX0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC150Q8NCX0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC150Q8NCX0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC150Q8NCX0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC150Q8NCX0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC150Q8NCX0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC150Q8NCX0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC150Q8NCX0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC150Q8NCX0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC150Q8NCX0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC150Q8NCX0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC150Q8NCX0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC150Q8NCX0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC150Q8NCX0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC150Q8NCX0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC150Q8NCX0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC150Q8NCX0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC150Q8NCX0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC150Q8NCX0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC150Q8NCX0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC150Q8NCX0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC150Q8NCX0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC150Q8NCX0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC150Q8NCX0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC150Q8NCX0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC150Q8NCX0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC150Q8NCX0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC150Q8NCX0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC150Q8NCX0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC150Q8NCX0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC150Q8NCX0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC150Q8NCX0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC150Q8NCX0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC150Q8NCX0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC150Q8NCX0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC150Q8NCX0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC150Q8NCX0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC150Q8NCX0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC150Q8NCX0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC150Q8NCX0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC150Q8NCX0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC150Q8NCX0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC150Q8NCX0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms