Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM1BQ8NB78 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM1BQ8NB78 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM1BQ8NB78 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM1BQ8NB78 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM1BQ8NB78 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM1BQ8NB78 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM1BQ8NB78 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM1BQ8NB78 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM1BQ8NB78 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM1BQ8NB78 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM1BQ8NB78 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM1BQ8NB78 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM1BQ8NB78 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM1BQ8NB78 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms